Biodiversiteit 1 - Taxa in Ruimte en Tijd (theorie)

Vakbeschrijving Biodiversiteit 1 - Taxa in Ruimte en Tijd (theorie)
Collegejaar: 2015-2016
Studiegidsnummer: 4022BD110
Docent(en):
  • Prof.dr. P.C. van Welzen
  • Dr. M.C. Roos
  • Dr. P.H. Hovenkamp
  • Dr. H. de Jong
  • Dr. N.J. de Voogd
  • W. Renema
Voertaal: Nederlands
Blackboard: Ja
EC: 6
Niveau: 200
Periode: Semester 2
Onderwijstijd in uren
(excl. zelfstudie):
145:00 uur
  • Geen Keuzevak
  • Geen Contractonderwijs
  • Geen Exchange
  • Geen Study Abroad
  • Geen Avondonderwijs
  • Geen A-la-Carte en Aanschuifonderwijs
  • Geen Honours Class

Toegangseisen

n.v.t

Contact

Coordinator: Dr. N.J. de Voogd
Email: nicole.devoogd@naturalis.nl

Beschrijving

Doel van de cursus is om studenten handvatten te geven om biodiversiteit op soortsniveau te bestuderen. De studenten krijgen, door colleges, oefeningen en opdrachten inzicht in de grondslagen en methodologie van systematiek en in het bijzonder van fylogenie reconstructie. Zij leren datamatrices opstellen door het formuleren van soorts- en homologiehypotheses, het uitvoeren van kenmerkanalyses en coderen van kenmerktoestanden in datamatrices, die geanalyseerd worden met computerprogrammatuur, waarvan de werking en de methodes transparant gemaakt worden. Hierbij wordt ook ruime aandacht besteed aan de verwerking van moleculaire gegevens, wat aansluit op het onderdeel moleculaire technieken. Door de resultaten te verwerken krijgen de studenten kijk op de grondslagen van de taxonomie, met name de principes van classificatie en nomenclatuur, en het maken van identificatiemiddelen. Eveneens wordt kennis gemaakt met biodiversiteitsanalyses op taxonomisch niveau en biogeografie (verspreidingen van soorten) in verschillende tijdschalen. Tevens wordt een overzicht gepresenteerd van onderzoek in Naturalis Biodiversity Center, van systematische disciplines en van toepassingen van systematische informatie.

Leerdoelen

Doelstellingen:
Inzicht in de theorie en praktijk van vergelijkend biologisch onderzoek, de systematische aanpak van biodiversiteitstudies en fylogenetische vraagstellingen.
Vergroting van het inzicht in een aantal basale biologische concepten (soort, homologie, ruimtelijke schaalgroottes, tijdschalen) en methoden (grondslagen systematiek & vergelijkende biologie, macro-evolutie, fylogeniereconstructie, interpretatie fylogenetische informatie, biogeografie)

Eindtermen:
Inzicht in:

  1. het doen van morfologische waarnemingen
  2. het hanteren van morfologische, fylogenetische en biogeografische concepten
  3. het onderscheiden van soorten en kenmerken
  4. het opstellen van een datamatrix
  5. het maken van een fylogenetische analyse
  6. het maken van een biogeografische analyse

Rooster

Van 29 februari tot en met 25 maart 2016, voor detailrooster zie Blackboard.

Globaal:
Week 1: Botanisch (morfologie hogere planten, bestuivingssyndromen, vrucht dispersie, determineren)
Week 1-2: Zoologisch
Week 2: Paleobotanie en -zoölogie
Week 3: Fylogenie
Week 4: Soortconcepten, Biogeografie

Onderwijsvorm

Practicum, hoorcolleges, demonstraties, oefeningen/opdrachten.

Toetsing

Schriftelijk tentamen

Blackboard

Aanvullende informatie en cursus documenten staan op Blackboard, evenals computeralgorithmes.

Literatuur

Syllabus

Aanmelden

Via USIS en daarna enrollen in Blackboard

Opmerkingen

Om de cursus Biodiversiteit 2 – Taxa in Ruimte en Tijd (praktijk) te kunnen volgen, dient deze cursus met goed gevolg te zijn afgelegd.

Talen